Chùa Hương Trản nằm cách bến Yến 1,5 km thuộcđịa phận thôn Hội Xá , xã  Hương Sơn. Theo văn bia còn lưu giữ lại trong khu nội tự: vào năm Đinh Mão niên hiệu Chính Hòa thứ sáu thời vua Lê Hy Tông 1686  hòa thượng Đạo Viên Quang về khai sơn khu hương thiên, đi qua đây dừng chân, nhà sư xem phong thủy thấy thế đất nơi đây có hình chiếc khánh vàng, dòng nước chảy lượn quanh, vượng khí tụ hội nên mới khuyến giáo dân thôn cúng Dàng khu đất này.

Sau khi được chấp thuận, tổ bèn thả chén cắm tích trượng - phù bôi Hương Trản phi tích trượng - Dựng thảo am lấy tên là Hương Trản Tự để ngày đêm thiền tụng, ứng tiếp thập phương.

Năm sau Bính Dần 1687, Tổ vào trùng hưng thiên Trù, từ đó khi vào núi thì ẩn trong động đào, tham thiền diện bích, lúc ra thì cao thanh phúng tụng ở Thiên Trù để tuyên dương diệu pháp khi hạ sơn thì lập đạo tràng thuyết pháp.

Sau khi tổ viên tịch thì nơi đây gián đoạn trụ trì. Đến năm nhâm thân niên hiệu Bảo Đại thứ 6 (1932), đại sư Thanh Tích kế đăng trụ trì  khu vực Hương Sơn mới trùng tu tôn tạo và mở rộng  qui mô của chùa và cử Hòa Thượng Thanh Vinh là pháp tử ra đảm đương gia để coi sóc phụng sự.

Khi Hòa Thượng Thanh Vinh viên tịch, chùa lại bị giặc pháp đốt phá và ném bom. chư tăng  và hương dân thu dọn ngôi tổ đường để thờ phật tạm.

Hòa thượng thích Thanh Chân trù trì khu vực Hương Sơn, cho đệ tử thứ tư là đại đức Thích Thanh Thìn ra đảm nhiệm chức đương gia. Đại đức Thanh Thìn được sự ủng hộ cử phật tử thập phương cùng dân thôn dựng lại chính điện, sửa sang lại nhà tổ.

Sau thời gian đó Đại Đức chuyển đến nơi khác tu hành, Chùa Hương Trản lại đựoc  giao cho dân thôn Hội xá hương đăng. đến năm 2006 Chùa đã xuống cấp nhiều. Sư thầy Thích đàm tịnh trụ trì chùa Thanh Sơn -  Hương Đài đảm nhiệm, cùng dân thôn Hội Xá, du khách thập phương đóng góp công,  của xây dựng lại Chùa  Hương Trản khang trang như hiện nay.